5.13. MMTF拓扑解析器

从中读取拓扑数据 Macromolecular Transmission Format (MMTF) format 。这通常应该是PDB的一个更快的替代方案。

使MMTF文件中的各个模型可通过 models 宇宙上的属性。

在 0.16.0 版本加入.

在 0.20.0 版本发生变更: 现在可以读取缺少/空可选字段的文件

在 2.0.0 版本发生变更: 别名 bfactors 拓扑属性为 tempfactorstempfactors 已弃用,将在3.0中删除(问题#1901)

读取以下拓扑属性:

原子:
  • AltLoc

  • 原子ID

  • 临时因素

  • 债券

  • 装药

  • 质量(猜测)

  • 名字

  • 入住率

  • 类型

残留物:
  • ICODE

  • 重命名

  • 残存

  • 重新编号

细分市场:
  • 塞吉德

  • 型号

5.13.1. 班级

class MDAnalysis.topology.MMTFParser.MMTFParser(filename)[源代码]