2. 拓扑系统

如中简要显示的 MDAnalysis概述 ，即 Universe 类是MDAnalysis中分子动力学数据的主要对象和核心接口。从文件加载拓扑信息时，如下所示：

>>> from MDAnalysis import Universe
>>> from MDAnalysis.tests.datafiles import PSF
>>> u = Universe(PSF)

文件被读取，内容被分析，并且 Topology 对象就是从这些内容构造的。