6.12. MMTF轨迹阅读器 MDAnalysis.coordinates.MMTF

从大分子传输格式中读取坐标数据 (MMTF) 。这通常应该是PDB的一个更快的替代方案。

在 0.16.0 版本加入.

在 0.20.0 版本发生变更: 单位单元格现在被正确地视为可选

6.12.1. 班级

class MDAnalysis.coordinates.MMTF.MMTFReader(filename, convert_units=True, n_atoms=None, **kwargs)

大分子传输格式的坐标阅读器 (MMTF) 。

MDAnalysis.coordinates.MMTF.fetch_mmtf(pdb_id)

使用MMTF格式从RCSB蛋白质数据库创建宇宙

参数:

pdb_id (string) -- 所需数据的PDB代码，例如‘4UCP’

返回:

相应的PDB系统的多维分析领域

返回类型:

Universe

参见

mmtf.fetch

获取原始MMTF数据的函数

在 0.16.0 版本加入.