6.4. DL_POLY格式阅读器 MDAnalysis.coordinates.DLPoly

读取DL Poly 格式化坐标文件

class MDAnalysis.coordinates.DLPoly.ConfigReader(filename, convert_units=True, n_atoms=None, **kwargs)[源代码]

DLPoly配置文件读取器

在 0.11.0 版本加入.

在 2.0.0 版本发生变更: 坐标、速度和力不再存储在‘F’内存布局中,而是现在使用默认的数值‘C’。

units = {'length': 'Angstrom', 'time': 'ps', 'velocity': 'Angstrom/ps'}

带有以下单位的词典 time长度 (及 速度 ..用于支持它的格式)

class MDAnalysis.coordinates.DLPoly.HistoryReader(filename, **kwargs)[源代码]

读取DLPoly格式的历史文件

在 0.11.0 版本加入.

close()[源代码]

关闭轨迹文件。

units = {'length': 'Angstrom', 'time': 'ps', 'velocity': 'Angstrom/ps'}

带有以下单位的词典 time长度 (及 速度 ..用于支持它的格式)