Bio.PDB结构模块¶
Structure类,表示大分子结构。
- class Bio.PDB.Structure.Structure(id)¶
基类:
Entity
Structure类包含一组Model实例。
- __init__(id)¶
初始化类。
- __repr__()¶
返回结构标识符。
- get_models()¶
退货模型。
- get_chains()¶
从模型返回链。
- get_residues()¶
从链上返回残基。
- get_atoms()¶
从残渣中返回原子。
- atom_to_internal_coordinates(verbose: bool = False) None ¶
从Atom X、Y、Z坐标创建/更新内部坐标。
内部坐标是键合长度、角度和二面角。
- 参数:
bool (verbose) -- 缺省FALSE描述运行时问题
- internal_to_atom_coordinates(verbose: bool = False) None ¶
从内部坐标创建/更新原子坐标。
- 参数:
bool (verbose) -- 缺省FALSE描述运行时问题
- 抛出:
Exception -- 如果任何链没有.pic属性