Bio.PDB结构模块

Structure类,表示大分子结构。

class Bio.PDB.Structure.Structure(id)

基类:Entity

Structure类包含一组Model实例。

__init__(id)

初始化类。

__repr__()

返回结构标识符。

get_models()

退货模型。

get_chains()

从模型返回链。

get_residues()

从链上返回残基。

get_atoms()

从残渣中返回原子。

atom_to_internal_coordinates(verbose: bool = False) None

从Atom X、Y、Z坐标创建/更新内部坐标。

内部坐标是键合长度、角度和二面角。

参数:

bool (verbose) -- 缺省FALSE描述运行时问题

internal_to_atom_coordinates(verbose: bool = False) None

从内部坐标创建/更新原子坐标。

参数:

bool (verbose) -- 缺省FALSE描述运行时问题

抛出:

Exception -- 如果任何链没有.pic属性