Bio.PDB.结构对齐模块¶
根据FASTA比对将两个结构的残基相互映射。
- class Bio.PDB.StructureAlignment.StructureAlignment(fasta_align, m1, m2, si=0, sj=1)¶
基类:
object
类根据两个结构的序列对齐来对齐两个结构。
- __init__(fasta_align, m1, m2, si=0, sj=1)¶
初始化。
- 属性:
FASTA_ALIGN-对齐对象
m1、m2-两种型号
Si,Sj-与结构相对应的比对对象中的序列
- get_maps()¶
映射结构之间的残基。
返回两个字典,它们将一个结构中的残基映射到另一个结构中的等价残基。
- get_iterator()¶
在所有剩余对上创建迭代器。