Bio.PDB.结构对齐模块

根据FASTA比对将两个结构的残基相互映射。

class Bio.PDB.StructureAlignment.StructureAlignment(fasta_align, m1, m2, si=0, sj=1)

基类:object

类根据两个结构的序列对齐来对齐两个结构。

__init__(fasta_align, m1, m2, si=0, sj=1)

初始化。

属性:
  • FASTA_ALIGN-对齐对象

  • m1、m2-两种型号

  • Si,Sj-与结构相对应的比对对象中的序列

get_maps()

映射结构之间的残基。

返回两个字典,它们将一个结构中的残基映射到另一个结构中的等价残基。

get_iterator()

在所有剩余对上创建迭代器。