Bio.PDB.选择模块

原子、残留物等的选择

Bio.PDB.Selection.uniqueify(items)

返回给定迭代数中唯一项的列表。

秩序没有得到维护。

Bio.PDB.Selection.get_unique_parents(entity_list)

将实体列表转换为其(唯一)父项列表。

Bio.PDB.Selection.unfold_entities(entity_list, target_level)

展开实体列表至子级别(例如链中的残留物)。

将实体列表展开为另一级别的实体列表。例如:

原子列表->残基列表模块列表->原子列表残基列表->链列表

  • ENTITY_LIST-实体或单个实体的列表

  • target_level-char(A,R,C,M,S)

请注意,如果ENTITY_LIST为空列表,则会返回一个空列表:

>>> unfold_entities([], "A")
[]