Bio.PDB.Model模块

Model类,在Structure对象中使用。

class Bio.PDB.Model.Model(id, serial_num=None)

基类:Entity

表示结构中模型的对象。

在从X射线结晶学实验中得出的结构中,只会出现一个模型(除了一些例外)。核磁共振结构通常包含许多不同的模型。

__init__(id, serial_num=None)

初始化。

参数:
  • ID-整型

  • Serial_Num-int

__repr__()

返回模型标识符。

get_chains()

返回链。

get_residues()

返还残留物。

get_atoms()

返回原子。

atom_to_internal_coordinates(verbose: bool = False) None

从Atom X、Y、Z坐标创建/更新内部坐标。

内部坐标是键合长度、角度和二面角。

参数:

bool (verbose) -- 缺省FALSE描述运行时问题

internal_to_atom_coordinates(verbose: bool = False) None

从内部坐标创建/更新原子坐标。

参数:

bool (verbose) -- 缺省FALSE描述运行时问题

抛出:

Exception -- 如果任何链没有.pic属性