Bio.PDB.Model模块¶
Model类,在Structure对象中使用。
- class Bio.PDB.Model.Model(id, serial_num=None)¶
基类:
Entity
表示结构中模型的对象。
在从X射线结晶学实验中得出的结构中,只会出现一个模型(除了一些例外)。核磁共振结构通常包含许多不同的模型。
- __init__(id, serial_num=None)¶
初始化。
- 参数:
ID-整型
Serial_Num-int
- __repr__()¶
返回模型标识符。
- get_chains()¶
返回链。
- get_residues()¶
返还残留物。
- get_atoms()¶
返回原子。
- atom_to_internal_coordinates(verbose: bool = False) None ¶
从Atom X、Y、Z坐标创建/更新内部坐标。
内部坐标是键合长度、角度和二面角。
- 参数:
bool (verbose) -- 缺省FALSE描述运行时问题
- internal_to_atom_coordinates(verbose: bool = False) None ¶
从内部坐标创建/更新原子坐标。
- 参数:
bool (verbose) -- 缺省FALSE描述运行时问题
- 抛出:
Exception -- 如果任何链没有.pic属性