Bio.PDB.MMCIFParser模块¶

mmCIF解析器。

class Bio.PDB.MMCIFParser.MMCIFParser(structure_builder=None, QUIET=False)¶

基类：object

解析mmCIF文件并返回Structure对象。

__init__(structure_builder=None, QUIET=False)¶

创建一个PDBParser对象。

mmCIF解析器调用聚合的结构构建器对象中的许多标准方法。通常情况下，此对象由MMCIParser对象本身实例化，但如果用户提供他/她自己的结构构建器对象，则使用后者。

参数：

Structure_Builder-一个可选的用户实现的Structure_Builder类。
Quiet-评估为布尔值。如果为TRUE，则在构建SMCRA数据时发出的警告将被抑制。如果为False(默认值)，则会显示它们。这些警告可能表示mmCIF文件中存在问题！

get_structure(structure_id, filename)¶

返回结构。

参数：

class Bio.PDB.MMCIFParser.FastMMCIFParser(structure_builder=None, QUIET=False)¶

基类：object

解析MMCIF文件并返回Structure对象。

__init__(structure_builder=None, QUIET=False)¶

创建一个FastMMCIFParser对象。

mmCIF解析器调用聚合的结构构建器对象中的许多标准方法。通常，该对象由解析器对象本身实例化，但是如果用户提供他/她自己的结构构建器对象，则使用后者。

该类与常规MMCIFParser之间的主要区别在于，这里只解析‘ATOM’和‘HETATM’行。如果您只对坐标信息感兴趣，请使用。

参数：

Structure_Builder-一个可选的用户实现的Structure_Builder类。
Quiet-评估为布尔值。如果为TRUE，则在构建SMCRA数据时发出的警告将被抑制。如果为False(默认值)，则会显示它们。这些警告可能表示mmCIF文件中存在问题！

get_structure(structure_id, filename)¶

返回结构。

参数：