Bio.SCOP.Hie模块

处理SCOP层次结构文件。

SCOP层次结构文件根据SCOP唯一标识符(SunID)描述SCOP层次结构。

SCOP中描述了文件格式 release notes

可以找到最新的HIE文件 elsewhere at SCOP

Release 1.55 (2001年7月)。

class Bio.SCOP.Hie.Record(line=None)

基类:object

保存SCOP层次结构中一个节点的信息。

属性:
  • SunID-此节点的SCOP唯一标识符

  • 父辈-父辈太阳光

  • 儿童-儿童伤寒序列

__init__(line=None)

初始化类。

__str__()

将SCOP层次结构记录表示为字符串。

Bio.SCOP.Hie.parse(handle)

迭代HIE文件作为每行的HIE记录。

参数:
  • 句柄-类似文件的对象。