Bio.SCOP.Hie模块¶
处理SCOP层次结构文件。
SCOP层次结构文件根据SCOP唯一标识符(SunID)描述SCOP层次结构。
SCOP中描述了文件格式 release notes 。
可以找到最新的HIE文件 elsewhere at SCOP 。
Release 1.55 (2001年7月)。
- class Bio.SCOP.Hie.Record(line=None)¶
基类:
object
保存SCOP层次结构中一个节点的信息。
- 属性:
SunID-此节点的SCOP唯一标识符
父辈-父辈太阳光
儿童-儿童伤寒序列
- __init__(line=None)¶
初始化类。
- __str__()¶
将SCOP层次结构记录表示为字符串。
- Bio.SCOP.Hie.parse(handle)¶
迭代HIE文件作为每行的HIE记录。
- 参数:
句柄-类似文件的对象。