Bio.SCOP.Dom模块

处理SCOP域文件。

DOM文件已正式弃用。有关更多信息,请参阅SCOP“Release notes.”:http://scop.berkeley.edu/release-notes-1.55.html the DOM files for Old Release for Old Release“(旧版本的DOM文件可以在SCOP.”:http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/parse/的其他位置找到

class Bio.SCOP.Dom.Record(line=None)

基类:object

保存一个SCOP域的信息。

属性:
  • SID-条目的SCOP ID,例如d1anu1

  • 残留物-作为残留物对象的结构域定义

  • Hierarchy-指定此域在层次结构中的位置的字符串。

__init__(line=None)

初始化类。

__str__()

将SCOP域记录表示为制表符分隔的字符串。

Bio.SCOP.Dom.parse(handle)

迭代DOM文件作为每行的DOM记录。

参数:
  • 句柄--类似文件的对象。