Bio.SCOP.Des模块

处理SCOP描述文件。

文件格式在范围“Release notes.”：http://scop.berkeley.edu/release-notes-1.55.html the Latest DES File Are be Find“中描述，位于SCOP.”：http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/parse/的其他位置

“发布1.55”：http://scop.berkeley.edu/parse/des.cla.scop.txt_1.55(2001年7月)

class Bio.SCOP.Des.Record(line=None)

基类：object

保存SCOP层次结构中一个节点的信息。

属性：

• SunID-SCOP唯一标识符

• nodetype-‘cl’(类)、‘cf’(折叠)、‘sf’(超家族)、‘fa’(科)、‘dm’(蛋白质)、‘sp’(种)、‘px’(域)之一。可以添加附加的节点类型。

• SCCS-SCOP简明分类字符串。例如b.1.2.1

• 名称-域(例如d1anu1)的SCOP ID(Sid)，对于其他节点类型，当前为空

• 描述-例如“所有β蛋白”，“纤维连接蛋白III型”，

__init__(line=None)

初始化类。

__str__()

将SCOP描述记录表示为制表符分隔的字符串。

Bio.SCOP.Des.parse(handle)

将DES文件作为每行的DES记录进行迭代。

参数：

• 句柄-类似文件的对象