Bio.SCOP.Cla模块¶
处理描述SCOP域的SCOP分类文件。
文件格式在SCOP“Release notes.”:http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/release-notes.html the Latest CLA file are be be“(可在SCOP.”:http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/parse/的其他位置找到最新的CLA文件)的范围中进行了说明
“Release 1.73”:http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/parse/dir.cla.scop.txt_1.73(2008年7月)
- class Bio.SCOP.Cla.Record(line=None)¶
基类:
object
保存一个SCOP域的信息。
- 属性:
SID-SCOP标识符。例如d1danl2
残留物-作为残留物对象的结构域定义
SCCS-SCOP简明分类字符串。例如b.1.2.1
SunID-此域的SCOP唯一标识符
Hierarchy-字典,键是nodetype,值是sunid,描述此域在SCOP层次结构中的位置。有关节点类型的描述,请参见范围模块。在旧版本的Biopython中,这曾经是(键、值)元组的列表(请参见错误3109)。
- __init__(line=None)¶
初始化类。
- __str__()¶
将SCOP分类记录表示为制表符分隔的字符串。
- Bio.SCOP.Cla.parse(handle)¶
迭代CLA文件作为每行的CLA记录。
- 参数:
句柄-类似文件的对象。