Bio.PDB.骰子模块

切碎(切块)结构的代码。

该模块由Bio.PDB.tract()函数在内部使用。

class Bio.PDB.Dice.ChainSelector(chain_id, start, end, model_id=0)

基类:object

只接受右链在开始和结束之间的残数。

除去氢、水和配体。默认情况下仅使用型号0。

__init__(chain_id, start, end, model_id=0)

初始化类。

accept_model(model)

验证型号是否与型号标识符匹配。

accept_chain(chain)

验证链是否与链标识符匹配。

accept_residue(residue)

验证残基序列是否在起始序列和结束序列之间。

accept_atom(atom)

验证原子是否不是氢。

Bio.PDB.Dice.extract(structure, chain_id, start, end, filename)

将选定部分写出到文件名。