Bio.PDB.骰子模块¶
切碎(切块)结构的代码。
该模块由Bio.PDB.tract()函数在内部使用。
- class Bio.PDB.Dice.ChainSelector(chain_id, start, end, model_id=0)¶
基类:
object
只接受右链在开始和结束之间的残数。
除去氢、水和配体。默认情况下仅使用型号0。
- __init__(chain_id, start, end, model_id=0)¶
初始化类。
- accept_model(model)¶
验证型号是否与型号标识符匹配。
- accept_chain(chain)¶
验证链是否与链标识符匹配。
- accept_residue(residue)¶
验证残基序列是否在起始序列和结束序列之间。
- accept_atom(atom)¶
验证原子是否不是氢。
- Bio.PDB.Dice.extract(structure, chain_id, start, end, filename)¶
将选定部分写出到文件名。