Bio.ExPASy.Prodoc模块

使用来自ProSite的prosite.doc文件的代码。

请参阅https://www.expasy.org/prosite/

使用以下设备进行测试:
  • 版本15.0,1998年7月

  • 版本16.0,1999年7月

  • 版本20.22,2007年11月13日

  • 版本20.43,2009年2月10日

功能:
  • 已读取仅包含一个Prodoc条目的Prodoc文件。

  • Parse迭代Prodoc文件中的条目。

班级:
  • 记录保存Prodoc数据。

  • 引用保存来自Prodoc引用的数据。

Bio.ExPASy.Prodoc.read(handle)

从正好具有一条Prodoc记录的文件中读入记录。

Bio.ExPASy.Prodoc.parse(handle)

迭代Prodoc文件中的记录。

class Bio.ExPASy.Prodoc.Record

基类:object

保存来自Prodoc记录的信息。

属性:
  • 记录的登录号。

  • ProSite_Refs元组列表(ProSite访问,ProSite名称)。

  • 文本自由格式文本。

  • 引用对象的引用列表。

__init__()

初始化类。

class Bio.ExPASy.Prodoc.Reference

基类:object

保存Prodoc引文中的信息。

属性:
  • 引用的编号。(字符串)

  • 作者作者姓名。

  • 引文描述了引文。

__init__()

初始化类。