Bio.ExPASy.Enzyme模块

在ExPASy上解析ExPASy上的酵素文件ymme.dat。

请参阅https://www.expasy.org/enzyme/

使用2009年3月3日的版本进行了测试。

功能:
  • 读取读取包含一个酶条目的文件

  • Parse读取包含多个酶条目的文件

班级:
  • 记录保存酶数据。

Bio.ExPASy.Enzyme.parse(handle)

解析酶记录。

此函数用于解析包含多条记录的酶文件。

参数:
  • 句柄-文件的句柄。

Bio.ExPASy.Enzyme.read(handle)

读一份酶记录。

此函数用于解析正好包含一条记录的酶文件。

参数:
  • 句柄-文件的句柄。

class Bio.ExPASy.Enzyme.Record

基类:dict

将ExPASy酶记录中的信息保存为Python字典。

每条记录包含以下关键字:

  • ID:EC编号

  • De:推荐名称

  • 答:备用名称(如果有)

  • CA:催化活性

  • cf:辅因数(如果有)

  • PR:指向与酶对应的ProSite文档条目的指针(如果有)

  • DR:指向与该酶相对应的Swiss-Prot蛋白序列条目的指针(如果有)

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__init__()

初始化类。

__repr__()

返回repr(Self)。

__str__()

返回str(Self)。