Bio.Emboss.Primer3模块

解析浮雕eprimer3程序输出的代码。

与Biopython中的其他地方一样，有两个输入函数Read和Parse，分别用于单记录输出和多记录输出。对于引物3，为每个靶序列创建单个记录对象，并且可以包含多个引物。

即，如果您使用单个目标序列运行eprimer3，请使用Read函数。如果您使用多个目标运行eprimer3，请使用parse函数迭代RetResult。

class Bio.Emboss.Primer3.Record

基类：object

表示来自引物3运行查找引物的信息。

成员：

• 引物-描述此目标序列的引物对的引物对象列表。

• 注释-记录的注释行

__init__()

初始化类。

class Bio.Emboss.Primer3.Primers

基类：object

由Primer3设计的一套底漆。

成员：

• Size-产品的长度，请注意您可以使用len(底漆)替代底漆。

• forward_seq

• forward_start

• forward_length

• forward_tm

• forward_gc

• reverse_seq

• reverse_start

• reverse_length

• reverse_tm

• reverse_gc

• internal_seq

• internal_start

• internal_length

• internal_tm

• internal_gc

__init__()

初始化类。

__len__()

底漆产品的长度(即产品尺寸)。

Bio.Emboss.Primer3.parse(handle)

作为Bio.Emboss.Primer3.Record对象迭代primer3输出。

Bio.Emboss.Primer3.read(handle)

将primer3输出解析为Bio.Emboss.Primer3.Record对象。

这适用于只有一个目标序列的情况。如果为多个序列设计引物，请使用Parse函数。