Bio.Emboss.PrimerSearch模块

代码,以互动的primersearch程序从浮雕。

class Bio.Emboss.PrimerSearch.InputRecord

基类:object

表示primersearch程序的输入文件。

这使得添加入门信息并将其写出为简单入门文件格式变得容易。

__init__()

初始化类。

__str__()

将primersearch输入记录汇总为字符串。

add_primer_set(primer_name, first_primer_seq, second_primer_seq)

将底漆信息添加到记录中。

class Bio.Emboss.PrimerSearch.OutputRecord

基类:object

表示来自初级搜索作业的信息。

放大器是一个字典,其中键是引物名称,值是PrimerSearchAmplizer对象的列表。

__init__()

初始化类。

class Bio.Emboss.PrimerSearch.Amplifier

基类:object

代表引物的单个扩增。

__init__()

初始化类。

Bio.Emboss.PrimerSearch.read(handle)

将PrimerSearchOutputRecord中的输出从PrimerSearchOutputRecord中获取。