Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_雪茄模块

Bio.SearchIO解析器，用于免除雪茄输出格式。

class Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_cigar.ExonerateCigarParser(handle)

基类：_BaseExonerateParser

免除雪茄串的解析器。

parse_alignment_block(header)

分析雪茄格式的对齐块，返回查询结果、命中率、hsps。

__abstractmethods__ = frozenset({})

__annotations__ = {'_ALN_MARK': 'Optional[str]'}

__firstlineno__ = 28

__static_attributes__ = ()

class Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_cigar.ExonerateCigarIndexer(filename, **kwargs)

基类：ExonerateVulgarIndexer

用于免除雪茄行的索引器类。

get_qresult_id(pos)

返回最近的雪茄行的查询ID。

__abstractmethods__ = frozenset({})

__annotations__ = {'_parser': 'type[_BaseExonerateParser]', '_query_mark': 'Optional[bytes]'}

__firstlineno__ = 88

__static_attributes__ = ()