生物。测序包

子模块

• 生物。测序。王牌模块
  • rd
    • rd.__init__()
    • rd.__firstlineno__
    • rd.__static_attributes__
  • qa
    • qa.__init__()
    • qa.__firstlineno__
    • qa.__static_attributes__
  • ds
    • ds.__init__()
    • ds.__firstlineno__
    • ds.__static_attributes__
  • af
    • af.__init__()
    • af.__firstlineno__
    • af.__static_attributes__
  • bs
    • bs.__init__()
    • bs.__firstlineno__
    • bs.__static_attributes__
  • rt
    • rt.__init__()
    • rt.__firstlineno__
    • rt.__static_attributes__
  • ct
    • ct.__init__()
    • ct.__firstlineno__
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  • wa
    • wa.__init__()
    • wa.__firstlineno__
    • wa.__static_attributes__
  • wr
    • wr.__init__()
    • wr.__firstlineno__
    • wr.__static_attributes__
  • Reads
    • Reads.__firstlineno__
    • Reads.__init__()
    • Reads.__static_attributes__
  • Contig
    • Contig.__firstlineno__
    • Contig.__static_attributes__
    • Contig.__init__()
  • parse()
  • ACEFileRecord
    • ACEFileRecord.__firstlineno__
    • ACEFileRecord.__static_attributes__
    • ACEFileRecord.__init__()
    • ACEFileRecord.sort()
  • read()
• 生物。测序。博士模块
  • Record
    • Record.__init__()
    • Record.__firstlineno__
    • Record.__static_attributes__
  • read()
  • parse()

模块内容

代码处理各种程序进行排序和汇编.

该代码处理Phred、Phrap和Consed等程序，这些程序提供了从测序读段调用碱基并将序列组装成重叠群的实用程序。