Bio.Compass包
模块内容
处理康普斯输出的代码，一个用于配置文件/配置文件比较的程序。
指南针的描述如下：
Sadreyev R、Grishin N. CompASS：一种用于比较多种蛋白质比对并评估统计学意义的工具。J Mol Biol.2003年2月7日;326（1）：317-36。
使用CompASS 1.24进行测试。
- Bio.Compass.read(handle)
读取包含一条康普斯记录的康普斯文件。
- Bio.Compass.parse(handle)
迭代康普斯文件中的记录。
- class Bio.Compass.Record
基类：
object保存一次指南针击中的信息。
Ali 1是查询，Ali 2是热门。
- __init__()
初始化课程。
- query_coverage()
返回对齐中涵盖的查询的长度。
- hit_coverage()
返回对齐中覆盖的命中长度。
- __firstlineno__ = 96
- __static_attributes__ = ('evalue', 'gap_threshold', 'hit', 'hit_aln', 'hit_filtered_length', 'hit_length', 'hit_neffseqs', 'hit_nseqs', 'hit_start', 'positives', 'query', 'query_aln', 'query_filtered_length', 'query_length', 'query_neffseqs', 'query_nseqs', 'query_start', 'sw_score')