Bio.SCOP.Hie模块
处理SCOP HIERarchy文件。
SCOP层次结构文件根据SCOP唯一标识符(sunid)描述SCOP层次结构。
SCOP中描述了文件格式 release notes .
可以找到最新的IE文件 elsewhere at SCOP .
Release 1.55 (July 2001年)。
- class Bio.SCOP.Hie.Record(line=None)
基类:
object
保存SCOP层次结构中一个节点的信息。
- 属性:
sunid -此节点的SCOP唯一标识符
父母-父母苏尼德
儿童-儿童sunids序列
- __init__(line=None)
初始化课程。
- __str__()
将SCOP层次结构记录表示为字符串。
- __firstlineno__ = 23
- __static_attributes__ = ('children', 'parent', 'sunid')
- Bio.SCOP.Hie.parse(handle)
重复IE文件,因为Hie记录每一行。
- 论点:
handle -类似文件的对象。