Bio.SCOP.Dom模块

处理SCOP DOMain文件。

该多姆文件已被正式弃用。有关更多信息,请参阅SCOP的发布说明。“:http://scop.berkeley.edu/release-notes-1.55.html可以在SCOP的其他地方找到”旧版本的多姆文件。”:http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/parse/

class Bio.SCOP.Dom.Record(line=None)

基类:object

保存一个SCOP域的信息。

属性:
  • sid -条目的SCOP ID,例如d1 anu 1

  • residues -作为Residues对象的域定义

  • 层次结构-指定此域在层次结构中的位置的字符串。

__init__(line=None)

初始化课程。

__str__()

将SCOP域记录表示为制表符分隔的字符串。

__firstlineno__ = 18
__static_attributes__ = ('hierarchy', 'residues', 'sid')
Bio.SCOP.Dom.parse(handle)

遍历DOM文件,作为每行的DOM记录。

论点:
  • handle --类似文件的对象。