Bio.SCOP.Dom模块
处理SCOP DOMain文件。
该多姆文件已被正式弃用。有关更多信息,请参阅SCOP的发布说明。“:http://scop.berkeley.edu/release-notes-1.55.html可以在SCOP的其他地方找到”旧版本的多姆文件。”:http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/parse/
- class Bio.SCOP.Dom.Record(line=None)
基类:
object
保存一个SCOP域的信息。
- 属性:
sid -条目的SCOP ID,例如d1 anu 1
residues -作为Residues对象的域定义
层次结构-指定此域在层次结构中的位置的字符串。
- __init__(line=None)
初始化课程。
- __str__()
将SCOP域记录表示为制表符分隔的字符串。
- __firstlineno__ = 18
- __static_attributes__ = ('hierarchy', 'residues', 'sid')
- Bio.SCOP.Dom.parse(handle)
遍历DOM文件,作为每行的DOM记录。
- 论点:
handle --类似文件的对象。