Bio.SCOP.Des模块

处理SCOP描述文件。

该文件格式在scop的发行说明中进行了描述。“：http://scop.berkeley.edu/release-notes-1.55.html最新的DES文件可以在SCOP的其他地方找到”。”：http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/parse/

“版本1.55”：http://scop.berkeley.edu/parse/des.cla.scop.txt_1.55（2001年7月）

class Bio.SCOP.Des.Record(line=None)

基类：object

保存SCOP层次结构中一个节点的信息。

属性：

• unid- SCOP唯一标识符

• 节点型-“cl”（类）、“CF”（折叠）、“sf”（超家族）、“fa”（家族）、“dm”（蛋白质）、“p”（物种）、“px”（域）之一。可以添加其他节点类型。

• sccs - SCOP简洁的分类字符串。例如b.1.2.1

• name -域的SCOP ID（sid）（例如d1 anu 1），对于其他节点类型，当前为空

• 描述-例如“所有β蛋白”、“III型纤连蛋白”、

__init__(line=None)

初始化课程。

__str__()

将SCOP描述记录表示为制表符分隔的字符串。

__firstlineno__ = 17

__static_attributes__ = ('description', 'name', 'nodetype', 'sccs', 'sunid')

Bio.SCOP.Des.parse(handle)

迭代DES文件作为每一行的Des记录。

论点：

• 句柄文件类对象