Bio. DBC. StructureAlliance模块
基于FASTA比对将两个结构的残基彼此映射。
- class Bio.PDB.StructureAlignment.StructureAlignment(fasta_align, m1, m2, si=0, sj=1)
基类:
object
类基于两个结构的序列对齐来对齐两个结构。
- __init__(fasta_align, m1, m2, si=0, sj=1)
初始化。
- 属性:
fasta_ign-对齐对象
m1、m2 -两种型号
si,sj -对齐对象中与结构相对应的序列
- get_maps()
映射结构之间的残基。
返回两个字典,将一个结构中的残基映射到另一个结构中的等值残基。
- get_iterator()
在所有剩余对上创建一个迭代器。
- __firstlineno__ = 15
- __static_attributes__ = ('duos', 'map12', 'map21')