Bio. DBC.结构模块
结构类别,代表大分子结构。
- class Bio.PDB.Structure.Structure(id)
基类:
Entity
[None
,Model
]结构类包含模型实例的集合。
- __init__(id)
初始化课程。
- __repr__()
返回结构标识符。
- get_models()
回归模特。
- get_chains()
模特的退货链。
- get_residues()
从链中返回残留物。
- get_atoms()
从残基中返回原子。
- atom_to_internal_coordinates(verbose: bool = False) None
从Atom X、Y、Z坐标创建/更新内部坐标。
内部坐标是键长、角和二面角。
- 参数:
bool (verbose) -- 默认为假描述运行时问题
- internal_to_atom_coordinates(verbose: bool = False) None
从内部坐标创建/更新原子坐标。
- 参数:
bool (verbose) -- 默认为假描述运行时问题
- 抛出:
Exception -- 如果任何链没有.internal_coord属性
- __annotations__ = {}
- __firstlineno__ = 18
- __orig_bases__ = (Bio.PDB.Entity.Entity[NoneType, ForwardRef('Model')],)
- __parameters__ = ()
- __static_attributes__ = ('level',)