Bio. DBC.模型模块
模型类,用于结构对象。
- class Bio.PDB.Model.Model(id, serial_num=None)
基类:
Entity
[Structure
,Chain
]表示结构中模型的对象。
在从X射线晶体学实验得到的结构中,只有一个模型存在(有一些例外)。NMR结构通常包含许多不同的模型。
- __init__(id, serial_num=None)
初始化。
- 论点:
id - int
Serial_num - int
- __repr__()
返回型号标识符。
- get_chains()
退货链。
- get_residues()
返回残留物。
- get_atoms()
返回原子。
- atom_to_internal_coordinates(verbose: bool = False) None
从Atom X、Y、Z坐标创建/更新内部坐标。
内部坐标是键长、角和二面角。
- 参数:
bool (verbose) -- 默认为假描述运行时问题
- __annotations__ = {}
- __firstlineno__ = 18
- __orig_bases__ = (Bio.PDB.Entity.Entity[ForwardRef('Structure'), ForwardRef('Chain')],)
- __parameters__ = ()
- __static_attributes__ = ('level', 'serial_num')
- internal_to_atom_coordinates(verbose: bool = False) None
从内部坐标创建/更新原子坐标。
- 参数:
bool (verbose) -- 默认为假描述运行时问题
- 抛出:
Exception -- 如果任何链没有.pic属性