Bio.SearchIO.HmmerIO.hmmer3_tab模块

用于HMMER表输出格式的Bio.SearchIO解析器。

class Bio.SearchIO.HmmerIO.hmmer3_tab.Hmmer3TabParser(handle)

基类：object

HMMER表格式的解析器。

__init__(handle)

初始化类。

__iter__()

迭代Hmmer3TabParser，生成查询结果。

class Bio.SearchIO.HmmerIO.hmmer3_tab.Hmmer3TabIndexer(filename, **kwargs)

基类：SearchIndexer

HMMER表输出的索引器类。

__iter__()

迭代文件句柄；生成键、起始偏移量和长度。

get_raw(offset)

从给定偏移量返回QueryResult对象的原始字节字符串。

__abstractmethods__ = frozenset({})

class Bio.SearchIO.HmmerIO.hmmer3_tab.Hmmer3TabWriter(handle)

基类：object

hmmer3-tab输出格式的编写器。

__init__(handle)

初始化类。

write_file(qresults)

写到手柄上。

返回写入了多少QueryResult、Hit和HSP对象的元组。