Bio.SCOP.残留物模块

来自PDB结构的残基的集合。

class Bio.SCOP.Residues.Residues(str=None)

基类:object

来自PDB结构的残基的集合。

此类提供使用SCOP域定义的代码。这些片段被简明地表示为一个或多个链片段。例如,“(1bba A:10-20,B:)”表示链A的残基10至20(含),以及PDB结构1bba中的链B的每个残基。PDB ID和方括号是可选的。此外,“-”表示具有一个未命名链的PBD结构的每个残基。

起始和结束残基ID由残基序列号和可选的单字母插入代码组成。例如“12”、“-1”、“1a”、“1000”

pdbid--可选的PDB ID,例如“1bba”

片段--元组序列(chainID、startResID、endResID)

__init__(str=None)

初始化类。

__str__()

将SCOP残基记录表示为字符串。