Bio.Phylo.NexusIO模块

I/O函数包装器,用于 Bio.Nexus 树木。

Bio.Phylo.NexusIO.parse(handle)

解析Nexus文件中的树。

使用旧的Nexus.Trees解析器提取树,将它们转换回普通的Newick树,并通过新的Newick解析器提供这些字符串。这样,我们还不需要修改Nexus模块。(也许我们最终会将Nexus更改为直接使用新的NewickIO解析器。)

Bio.Phylo.NexusIO.write(obj, handle, **kwargs)

编写一个包含给定树的新Nexus文件。

使用简单的Nexus模板和NewickIO编写器仅序列化有效Nexus文件所需的树和最少的支持信息。