Bio.Phylo.NexusIO模块¶
I/O函数包装器,用于 Bio.Nexus
树木。
- Bio.Phylo.NexusIO.parse(handle)¶
解析Nexus文件中的树。
使用旧的Nexus.Trees解析器提取树,将它们转换回普通的Newick树,并通过新的Newick解析器提供这些字符串。这样,我们还不需要修改Nexus模块。(也许我们最终会将Nexus更改为直接使用新的NewickIO解析器。)
- Bio.Phylo.NexusIO.write(obj, handle, **kwargs)¶
编写一个包含给定树的新Nexus文件。
使用简单的Nexus模板和NewickIO编写器仅序列化有效Nexus文件所需的树和最少的支持信息。