Bio.AlignIO.ClustalIO模块

Bio.AlignIO支持CLUSTAL W和其他工具的“Clustal”输出。

您需要通过Bio.AlignIO函数使用此模块(如果您想要直接处理有间隙的序列,则通过Bio.SeqIO函数)。

class Bio.AlignIO.ClustalIO.ClustalWriter(handle)

基类:SequentialAlignmentWriter

CLUSTORW排列写入器。

write_alignment(alignment)

使用此选项将(另一个)单对齐写入打开的文件。

class Bio.AlignIO.ClustalIO.ClustalIterator(handle, seq_count=None)

基类:AlignmentIterator

Cluastw对齐迭代器。

__next__()

从句柄解析下一个对齐方式。