生物。图案。桅杆模块
支持Motif对齐和搜索工具(MAST)的模块。
- class Bio.motifs.mast.Record
基类:
list
用于保存MAST运行结果的类。
桅杆。记录保存有关图案和序列之间匹配的数据。Record持有的主题是类meme.Motiff的对象。
master.Record类继承自列表,因此您可以通过索引访问记录中的各个主题。或者,您可以通过其名称找到主题:
>>> from Bio import motifs >>> with open("motifs/mast.crp0.de.oops.txt.xml") as f: ... record = motifs.parse(f, 'MAST') >>> motif = record[0] >>> print(motif.name) 1 >>> motif = record['1'] >>> print(motif.name) 1
- __init__()
初始化课程。
- __getitem__(key)
返回索引键的主题。
- __firstlineno__ = 13
- __static_attributes__ = ('alphabet', 'database', 'diagrams', 'sequences', 'strand_handling', 'version')
- Bio.motifs.mast.read(handle)
将MAST HTML格式的处理解析为Record对象。