生物。图案。集群破坏模块
解析集群破坏者位置频率矩阵文件。
- class Bio.motifs.clusterbuster.Record(iterable=(), /)
基类:
list
类将信息存储在集群Buster矩阵表中。
该记录继承自包含各个主题的列表。
- __str__()
返回Record对象中图案的字符串表示形式。
- __firstlineno__ = 12
- __static_attributes__ = ()
- Bio.motifs.clusterbuster.read(handle)
从文件句柄中读取Cluster Buster位置频率矩阵格式的图案。
集群终结者主题格式:https://bu.wenglab.org/cluster-buster/help/cis-format.html
- Bio.motifs.clusterbuster.write(motifs, precision=0)
以集群破坏者位置频率矩阵格式返回主题的表示。
默认情况下 (precision=0 )集群破坏者位置频率矩阵将用整值写入。如果设置了更高的精度值,则集群破坏者位置频率矩阵将被写为浮点数, x 小数位。