Bio.SeqIO.SwissIO模块

Bio.SeqIO支持“swiss”（又名SwissProt/UniProt）文件格式。

您需要通过Bio.SeqIO功能使用此模块。另请参阅Bio.SwissProt模块，它提供的不仅仅是将序列作为SeqRecord对象访问。

另请参阅Bio.SeqIO.UniprotIO.py，它支持“uniprot-html”格式。

class Bio.SeqIO.SwissIO.SwissIterator(source: IO[str] | PathLike | str | bytes)

基类：SequenceIterator

解析器将Swiss-Prot/UniProt文件分解为SeqRecord对象。

modes = 't'

__init__(source: IO[str] | PathLike | str | bytes) → None

迭代Swiss-Prot文件并返回SeqRecord对象。

论点：

• 源-以文本模式打开的输入流，或文件的路径

从ID行到终止//的每个部分都成为一个具有相关注释和功能的SeqRecord。

此解析器适用于平面文件“swiss”格式，如：

• Swiss-Prot又名SwissProt

• TrEMBL

• UniProtKB又名UniProt知识库

为了与BioPerl和CLASS保持一致，我们将其称为“瑞士”格式。另请参阅SeqIO对“uniprot-html”格式的支持。

您不需要直接调用它，而是需要通过Bio.SeqIO.parse（.，格式=“swiss”）。

__next__()

返回下一个SeqRecord。

此方法必须由子类实现。

__abstractmethods__ = frozenset({})

__annotations__ = {}

__firstlineno__ = 27

__parameters__ = ()

__static_attributes__ = ()