Bio.SearchIO.HmmerIO.hmmer3_文本模块

HMMER纯文本输出格式的Bio.SearchIO解析器。

class Bio.SearchIO.HmmerIO.hmmer3_text.Hmmer3TextParser(handle)

基类:object

HMMER 3.0文本输出的解析器。

__init__(handle)

初始化课程。

__iter__()

迭代查询结果。

__firstlineno__ = 39
__static_attributes__ = ('_meta', 'handle', 'line')
class Bio.SearchIO.HmmerIO.hmmer3_text.Hmmer3TextIndexer(*args, **kwargs)

基类:_BaseHmmerTextIndexer

用于HMMER纯文本输出的索引器类。

qresult_start = b'Query: '
qresult_end = b'//'
__iter__()

在Hmmer 3 TextIndexer上迭代;生成查询结果的键,偏差,0。

__abstractmethods__ = frozenset({})
__annotations__ = {}
__firstlineno__ = 424
__static_attributes__ = ()