Bio.SearchIO.HmmerIO.hmmer3_文本模块
HMMER纯文本输出格式的Bio.SearchIO解析器。
- class Bio.SearchIO.HmmerIO.hmmer3_text.Hmmer3TextParser(handle)
基类:
object
HMMER 3.0文本输出的解析器。
- __init__(handle)
初始化课程。
- __iter__()
迭代查询结果。
- __firstlineno__ = 39
- __static_attributes__ = ('_meta', 'handle', 'line')
- class Bio.SearchIO.HmmerIO.hmmer3_text.Hmmer3TextIndexer(*args, **kwargs)
基类:
_BaseHmmerTextIndexer
用于HMMER纯文本输出的索引器类。
- qresult_start = b'Query: '
- qresult_end = b'//'
- __iter__()
在Hmmer 3 TextIndexer上迭代;生成查询结果的键,偏差,0。
- __abstractmethods__ = frozenset({})
- __annotations__ = {}
- __firstlineno__ = 424
- __static_attributes__ = ()