Bio.SearchIO.BlastIO.blast_tab模块

Bio.SearchIO解析器，用于BST+选项卡输出格式，带或不带注释。

class Bio.SearchIO.BlastIO.blast_tab.BlastTabIndexer(filename, comments=False, fields=_DEFAULT_FIELDS)

基类：SearchIndexer

用于BST+选项卡输出的索引器类。

__init__(filename, comments=False, fields=_DEFAULT_FIELDS)

初始化课程。

__iter__()

迭代文件手柄;产生关键字、开始偏差和长度。

get_raw(offset)

从给定的偏置量返回CredyResponse对象的原始字节字符串。

__abstractmethods__ = frozenset({})

__annotations__ = {}

__firstlineno__ = 525

__static_attributes__ = ('_key_idx',)

class Bio.SearchIO.BlastIO.blast_tab.BlastTabParser(handle, comments=False, fields=_DEFAULT_FIELDS)

基类：object

AMPS表格格式的解析器。

__init__(handle, comments=False, fields=_DEFAULT_FIELDS)

初始化课程。

__iter__()

迭代BlastTabParser，产生查询结果。

__firstlineno__ = 209

__static_attributes__ = ('fields', 'handle', 'has_comments', 'line')

class Bio.SearchIO.BlastIO.blast_tab.BlastTabWriter(handle, comments=False, fields=_DEFAULT_FIELDS)

基类：object

blast-tab输出格式的编写器。

__init__(handle, comments=False, fields=_DEFAULT_FIELDS)

初始化课程。

write_file(qresults)

写入到手柄，返回已写入多少个KYSYS对象。

__firstlineno__ = 682

__static_attributes__ = ('fields', 'handle', 'has_comments')