Bio.SCOP.残留物模块

来自TSB结构的残基的集合。

class Bio.SCOP.Residues.Residues(str=None)

基类:object

来自TSB结构的残基的集合。

此类提供处理SCOP域定义的代码。这些被简洁地表达为一个或多个链片段。例如,“(1bba A:10-20,B:)”表示ppb结构1bba中链A的10至20(包括)残基,以及链B的每个残基。pdb id和方括号是可选的。此外,“-”表示具有一条未命名链的pbd结构的每个残基。

开始和结束残基id由残基序列号和可选的单字母插入代码组成。例如“12”、“-1”、“1a”、“1000”

pdbid --可选的DBC id,例如“1bba”

片段--二元组序列(chainID、startResID、endResID)

__init__(str=None)

初始化课程。

__str__()

将SCOP残数记录表示为字符串。

__firstlineno__ = 15
__static_attributes__ = ('fragments', 'pdbid')