Bio. DBC.mmcifio模块

写入mm到岸文件。

请参阅https://www.iucr.org/resources/cif/spec/version1.1/cifsyntax了解语法。

class Bio.PDB.mmcifio.MMCIFIO

基类：StructureIO

将结构对象或mminf字典编写为mminf文件。

示例

>>> from Bio.PDB import MMCIFParser
>>> from Bio.PDB.mmcifio import MMCIFIO
>>> parser = MMCIFParser()
>>> structure = parser.get_structure("1a8o", "PDB/1A8O.cif")
>>> io=MMCIFIO()
>>> io.set_structure(structure)
>>> io.save("bio-pdb-mmcifio-out.cif")
>>> import os
>>> os.remove("bio-pdb-mmcifio-out.cif")  # tidy up

__init__()

初始化。

set_dict(dic)

设置要写出的mminf字典。

save(filepath, select=_select, preserve_atom_numbering=False)

将结构保存到文件。

参数:

• filepath (string or filehandle) -- 输出文件

• select (object) -- 选择要写入的实体。

通常select是L{Select}的一个子集，它应该有以下方法：

• accept_mode（模型）

• accept_chain（chain）

• accept_residue（residue）

• accept_atom（atom）

如果要写出实体，这些方法应该返回1，否则应该返回0。

__annotations__ = {}

__firstlineno__ = 51

__static_attributes__ = ('dic',)