Bio.EmBoss.PrimerSearch模块

与CLARSS的primersearch程序交互的代码。

class Bio.Emboss.PrimerSearch.InputRecord

基类：object

将输入文件表示到primersearch程序中。

这使得添加入门信息并将其写入简单的入门文件格式变得容易。

__init__()

初始化课程。

__str__()

将primersearch输入记录总结为字符串。

add_primer_set(primer_name, first_primer_seq, second_primer_seq)

将入门信息添加到记录中。

__firstlineno__ = 11

__static_attributes__ = ('primer_info',)

class Bio.Emboss.PrimerSearch.OutputRecord

基类：object

代表来自primersearch作业的信息。

放大器是一个字典，其中键是PrimerSearchAmplier对象列表，值是PrimerSearchAmplier对象列表。

__init__()

初始化课程。

__firstlineno__ = 34

__static_attributes__ = ('amplifiers',)

class Bio.Emboss.PrimerSearch.Amplifier

基类：object

表示来自引物的单个扩增。

__init__()

初始化课程。

__firstlineno__ = 46

__static_attributes__ = ('hit_info', 'length')

Bio.Emboss.PrimerSearch.read(handle)

将primersearch的输出获取到PrimerSearchOutputRecord。