Bio.Emboss.Primer3模块

用于分析CLARSS eprimer3程序输出的代码。

与Biopython的其他地方一样，有两个输入函数：读取和解析，用于单记录输出和多记录输出。对于primer 3，为每个目标序列创建单个记录对象，并且可以包含多个primer。

即，如果您使用单个目标序列运行eprimer3，请使用读取功能。如果您运行带有多个目标的eprimer3，请使用parse函数对返回结果进行迭代。

class Bio.Emboss.Primer3.Record

基类：object

代表来自primer 3运行寻找primer的信息。

成员：

• primers -描述此目标序列的引物对的Primer对象列表。

• 评论-记录的评论行

__init__()

初始化课程。

__firstlineno__ = 26

__static_attributes__ = ('comments', 'primers')

class Bio.Emboss.Primer3.Primers

基类：object

Primer 3设计的一套底漆。

成员：

• 尺寸-产品长度，请注意，您可以使用镜片（底漆）作为底漆的替代品。尺寸

• forward_seq

• forward_start

• forward_length

• forward_tm

• forward_gc

• reverse_seq

• reverse_start

• reverse_length

• reverse_tm

• reverse_gc

• internal_seq

• internal_start

• internal_length

• internal_tm

• internal_gc

__init__()

初始化课程。

__len__()

底漆产品的长度（即产品尺寸）。

__firstlineno__ = 43

__static_attributes__ = ('forward_gc', 'forward_length', 'forward_seq', 'forward_start', 'forward_tm', 'internal_gc', 'internal_length', 'internal_seq', 'internal_start', 'internal_tm', 'reverse_gc', 'reverse_length', 'reverse_seq', 'reverse_start', 'reverse_tm', 'size')

Bio.Emboss.Primer3.parse(handle)

将primer3输出迭代为Bio.Emboss.Primer3.Record对象。

Bio.Emboss.Primer3.read(handle)

将primer3输出解析为Bio.Emboss.Primer3.Record对象。

这适用于存在且只有一个目标序列时。如果为多个序列设计PCR，请使用解析功能。