Bio.Align.clustal模块

Bio。调整对CLUSTIN W和其他工具的“clustal”输出的支持。

预计您将通过Bio.Align函数（或Bio.SeqIO函数，如果您仅对序列感兴趣）使用此模块。

class Bio.Align.clustal.AlignmentWriter(target)

基类：AlignmentWriter

克拉斯特洛结盟作家。

fmt: str | None = 'Clustal'

write_header(stream, alignments)

使用此命令写入文件头。

format_alignment(alignment)

以Classal格式返回具有单一对齐方式的字符串。

__abstractmethods__ = frozenset({})

__annotations__ = {'fmt': 'Optional[str]'}

__firstlineno__ = 20

__static_attributes__ = ()

class Bio.Align.clustal.AlignmentIterator(source)

基类：AlignmentIterator

Custalw对齐迭代器。

fmt: str | None = 'Clustal'

__abstractmethods__ = frozenset({})

__annotations__ = {'fmt': 'Optional[str]'}

__firstlineno__ = 95

__static_attributes__ = ('metadata',)