Bio.Motifs.Mast模块

支持Motif比对和搜索工具(MAST)的模块。

class Bio.motifs.mast.Record

基类:list

用于保存桅杆运行结果的类。

一个mast.Record保存关于模体和序列之间匹配的数据。记录保存的主题是Meme.Motif类的对象。

mast.Record类继承自List,因此您可以通过索引访问记录中的各个主题。或者,您也可以按其名称查找主题:

>>> from Bio import motifs
>>> with open("motifs/mast.crp0.de.oops.txt.xml") as f:
...     record = motifs.parse(f, 'MAST')
>>> motif = record[0]
>>> print(motif.name)
1
>>> motif = record['1']
>>> print(motif.name)
1
__init__()

初始化类。

__getitem__(key)

返回索引键的Motif。

Bio.motifs.mast.read(handle)

将主XML格式句柄解析为记录对象。