Bio.Motifs.Mast模块¶
支持Motif比对和搜索工具(MAST)的模块。
- class Bio.motifs.mast.Record¶
基类:
list
用于保存桅杆运行结果的类。
一个mast.Record保存关于模体和序列之间匹配的数据。记录保存的主题是Meme.Motif类的对象。
mast.Record类继承自List,因此您可以通过索引访问记录中的各个主题。或者,您也可以按其名称查找主题:
>>> from Bio import motifs >>> with open("motifs/mast.crp0.de.oops.txt.xml") as f: ... record = motifs.parse(f, 'MAST') >>> motif = record[0] >>> print(motif.name) 1 >>> motif = record['1'] >>> print(motif.name) 1
- __init__()¶
初始化类。
- __getitem__(key)¶
返回索引键的Motif。
- Bio.motifs.mast.read(handle)¶
将主XML格式句柄解析为记录对象。