Bio.SwissProt.KeyWList模块¶
从SwissProt/UniProt解析keywlist.txt文件的代码。
- 请参见:
- 班级:
记录在keywlist.txt文件中存储有关一个关键字或一个类别的信息。
- 功能:
解析keywlist.txt文件并返回指向其包含的记录的迭代器。
- class Bio.SwissProt.KeyWList.Record¶
基类:
dict
存储关键字列表中的一个关键字或类别的信息。
该记录将一个关键字或类别的信息作为Python字典存储在keywlist.txt中。此词典中的键是可以出现在keywlist.txt文件中的行代码::
--------- --------------------------- ---------------------- Line code Content Occurrence in an entry --------- --------------------------- ---------------------- ID Identifier (keyword) Once; starts a keyword entry IC Identifier (category) Once; starts a category entry AC Accession (KW-xxxx) Once DE Definition Once or more SY Synonyms Optional; once or more GO Gene ontology (GO) mapping Optional; once or more HI Hierarchy Optional; once or more WW Relevant WWW site Optional; once or more CA Category Once per keyword entry; absent in category entries
- __init__()¶
初始化类。
- Bio.SwissProt.KeyWList.parse(handle)¶
从文件句柄解析关键字列表。
返回一个生成器对象,该对象生成作为Bio.SwissProt.KeyWList.Record()对象的关键字条目。