Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_Text模块

Bio.SearchIO解析器,用于免责纯文本输出格式。

class Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_text.ExonerateTextParser(handle)

基类:_BaseExonerateParser

用于免除纯文本输出的解析器。

parse_alignment_block(header)

解析对齐挡路,返回查询结果,命中,HSPs。

__abstractmethods__ = frozenset({})
class Bio.SearchIO.ExonerateIO.exonerate_text.ExonerateTextIndexer(filename, **kwargs)

基类:_BaseExonerateIndexer

用于免除纯文本的索引器类。

get_qresult_id(pos)

从最近的“query:”行返回查询ID。

get_raw(offset)

从给定偏移量返回QueryResult对象的原始字符串。

__abstractmethods__ = frozenset({})