Bio.HMM实用程序模块

对使用HMM有用的通用功能。

这只是收集您可能想要在处理HMM时使用的常规函数。

Bio.HMM.Utilities.pretty_print_prediction(emissions, real_state, predicted_state, emission_title='Emissions', real_title='Real State', predicted_title='Predicted State', line_width=75)

以漂亮的方式打印出状态序列预测。

参数:
  • 排放--您正在处理的序列的排放序列。

  • REAL_STATE--生成排放的实际状态路径。

  • FORECTED_STATE-由某种HMM模型预测的状态路径。