Bio. DBC.Dice模块
用于切碎(切片)结构的代码。
该模块由Bio. PDB.extract()函数内部使用。
- class Bio.PDB.Dice.ChainSelector(chain_id, start, end, model_id=0)
基类:
object
仅接受开始和结束之间具有右链的残基。
除去氢、水和配体。默认情况下仅使用型号0。
- __init__(chain_id, start, end, model_id=0)
初始化课程。
- accept_model(model)
验证型号是否与型号标识符匹配。
- accept_chain(chain)
验证链是否匹配链标识符。
- accept_residue(residue)
验证残基序列是否位于开始序列和结束序列之间。
- accept_atom(atom)
验证原子是否不是氢。
- __firstlineno__ = 22
- __static_attributes__ = ('chain_id', 'end', 'model_id', 'start')
- Bio.PDB.Dice.extract(structure, chain_id, start, end, filename)
将所选部分写入文件名。