Bio. DBC.Dice模块

用于切碎(切片)结构的代码。

该模块由Bio. PDB.extract()函数内部使用。

class Bio.PDB.Dice.ChainSelector(chain_id, start, end, model_id=0)

基类:object

仅接受开始和结束之间具有右链的残基。

除去氢、水和配体。默认情况下仅使用型号0。

__init__(chain_id, start, end, model_id=0)

初始化课程。

accept_model(model)

验证型号是否与型号标识符匹配。

accept_chain(chain)

验证链是否匹配链标识符。

accept_residue(residue)

验证残基序列是否位于开始序列和结束序列之间。

accept_atom(atom)

验证原子是否不是氢。

__firstlineno__ = 22
__static_attributes__ = ('chain_id', 'end', 'model_id', 'start')
Bio.PDB.Dice.extract(structure, chain_id, start, end, filename)

将所选部分写入文件名。