Bio.ExPasy.酶模块

在ExPASy上解析来自酶的enzyme.dat文件。

请参阅https://www.expasy.org/enzyme/

已于2009年3月3日发布时进行测试。

功能:
  • 读 读取包含一个ENZYME条目的文件

  • 解析 读取包含多个ENZYME条目的文件

职业:
  • 记录 保存EnzYME数据。

Bio.ExPASy.Enzyme.parse(handle)

解析酶记录。

该功能用于解析包含多个记录的ENZYME文件。

论点:
  • 手柄 - 文件的处理。

Bio.ExPASy.Enzyme.read(handle)

阅读一条EnzYME记录。

该函数用于解析仅包含一条记录的ENZYME文件。

论点:
  • 手柄 - 文件的处理。

class Bio.ExPASy.Enzyme.Record

基类:dict

将ExPasy ENZYME记录中的信息保存为Python词典。

每条记录包含以下密钥:

  • ID:EC号

  • DE:推荐名称

  • AN:替代名称(如果有的话)

  • CA:催化活性

  • CF:辅因子(如有)

  • PR:指向与酶对应的任何Prosite文档条目

  • DR:指向与酶对应的任何Swiss-Prot蛋白序列条目

  • CC:评论

__init__()

初始化课程。

__repr__()

返回Record对象的规范字符串表示形式。

__str__()

返回Record对象的可读字符串表示形式。

__firstlineno__ = 58
__static_attributes__ = ()