Bio.ExPasy.酶模块
在ExPASy上解析来自酶的enzyme.dat文件。
请参阅https://www.expasy.org/enzyme/
已于2009年3月3日发布时进行测试。
- 功能:
读 读取包含一个ENZYME条目的文件
解析 读取包含多个ENZYME条目的文件
- 职业:
记录 保存EnzYME数据。
- Bio.ExPASy.Enzyme.parse(handle)
解析酶记录。
该功能用于解析包含多个记录的ENZYME文件。
- 论点:
手柄 - 文件的处理。
- Bio.ExPASy.Enzyme.read(handle)
阅读一条EnzYME记录。
该函数用于解析仅包含一条记录的ENZYME文件。
- 论点:
手柄 - 文件的处理。
- class Bio.ExPASy.Enzyme.Record
基类:
dict
将ExPasy ENZYME记录中的信息保存为Python词典。
每条记录包含以下密钥:
ID:EC号
DE:推荐名称
AN:替代名称(如果有的话)
CA:催化活性
CF:辅因子(如有)
PR:指向与酶对应的任何Prosite文档条目
DR:指向与酶对应的任何Swiss-Prot蛋白序列条目
CC:评论
- __init__()
初始化课程。
- __repr__()
返回Record对象的规范字符串表示形式。
- __str__()
返回Record对象的可读字符串表示形式。
- __firstlineno__ = 58
- __static_attributes__ = ()