对给定位置的偏移信号

越来越多的实验类型需要通过将来自每个对准点的信号聚焦在一个点上进行分析。例如,核糖核酸序列的排列倾向于偏移,使得信号暂停集中在翻译起始点周围,偏移量约为12。或者,在Groseq实验中,通过使用每个读取的第一个基数,TSS周围的暂停变得居中。这可以在 bamCoverage 使用 --Offset 选项。可视化示例如下:

../../_images/feature-offset0.png

上面显示的对齐方式与一个文本重叠,表示为一个蓝色框,在本例中,它只表示编码序列。如果校准来自于一个核糖核酸实验,那么每个校准的信号应该设置在每个校准的第12个碱基上。右边的部分表示产生的信号强度,在翻译起始点处有预期的大峰值。

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