scipy.stats.DiscreteAliasUrn

class scipy.stats.DiscreteAliasUrn(dist, *, domain=None, urn_factor=1, random_state=None)

离散别名-骨灰盒方法。

该方法适用于有限域的单变量离散分布的抽样。它使用大小的概率向量 \(N\) 或具有有限支持的概率质量函数以从分布生成随机数。

参数
distARRAY_LIKE或OBJECT,可选

分布的概率向量(PV)。如果PV不可用,则使用 pmf 方法是必需的。预计PMF的签名为: def pmf(self, k: int) -> float 。即它应该接受Python整数并返回Python浮点。

domain整型,可选

对PMF的支持。如果概率向量 (pv )不可用,则必须给出有限域。即PMF必须具有有限支撑。默认值为 None 。什么时候 None

  • 如果一个 support 方法由分发对象提供 dist ,用于设置分布的域。

  • 否则,将假定支持为 (0, len(pv)) 。当该参数与概率向量组合传递时, domain[0] 用于将分发从 (0, len(pv))(domain[0], domain[0]+len(pv))domain[1] 被忽略。有关更详细的说明,请参阅注释和教程。

urn_factor浮动,可选

骨灰盒表格的大小 相对的 到概率向量的大小。它不能小于1。表越大,生成时间越快,但需要更昂贵的设置。默认值为1。

random_state :{无,整型, numpy.random.Generator{无,整型,

用于生成均匀随机数流的基础NumPy随机数生成器的NumPy随机数生成器或种子。如果 random_state 为无(或 np.random )、 numpy.random.RandomState 使用的是Singleton。如果 random_state 是一个整型、一个新的 RandomState 实例,其种子设定为 random_state 。如果 random_state 已经是一个 GeneratorRandomState 实例,则使用该实例。

注意事项

当有限概率向量可用或分布的PMF可用时,此方法起作用。如果只有PMF可用,则 有限的 还必须提供PMF的支持(域)。建议首先通过评估支撑中每个点的PMF,然后使用它来获得概率向量。

如果给定了概率向量,则它必须是非负浮点数的一维数组,不带任何 infnan 价值。此外,必须至少有一个非零条目,否则会引发异常。

默认情况下,概率向量从0开始编制索引。但是,这可以通过传递一个 domain 参数。什么时候 domain 与pv结合使用时,它的效果是将分布从 (0, len(pv))(domain[0]domain[0] + len(pv))domain[1] 在这种情况下被忽略。

该参数 urn_factor 可以增加以增加设置时间为代价来更快地生成。该方法使用表格生成随机变量。 urn_factor 控制此表格相对于概率向量大小的大小(如果PV不可用,则控制支撑的宽度)。由于此表是在设置时计算的,因此增加此参数会线性增加设置所需的时间。建议将此参数控制在2以下。

参考文献

1

联合国参考手册,第5.8.2节,“DAU-(离散)别名-URN方法”,http://statmath.wu.ac.at/software/unuran/doc/unuran.html#DAU

2

A.J.沃克(1977)。一种产生具有一般分布的离散随机变量的有效方法ACM Trans。数学课。软件3,第253-256页。

示例

>>> from scipy.stats import DiscreteAliasUrn

要使用概率向量创建随机数生成器,请使用:

>>> pv = [0.1, 0.3, 0.6]
>>> urng = np.random.default_rng()
>>> rng = DiscreteAliasUrn(pv, random_state=urng)

已设置RNG。现在,我们可以使用 rvs 从分布生成样本的方法:

>>> rvs = rng.rvs(size=1000)

要验证随机变量是否服从给定的分布,我们可以使用卡方检验(作为拟合优度的度量):

>>> from scipy.stats import chisquare
>>> _, freqs = np.unique(rvs, return_counts=True)
>>> freqs = freqs / np.sum(freqs)
>>> freqs
array([0.092, 0.292, 0.616])
>>> chisquare(freqs, pv).pvalue
0.9993602047563164

由于p值很高,我们不能拒绝观测频率与预期频率相同的零假设。因此,我们可以安全地假设变量是从给定的分布中生成的。请注意,这只给出了算法的正确性,而不是样本的质量。

如果PV不可用,还可以传递具有PMF方法和有限域的类的实例。

>>> urng = np.random.default_rng()
>>> class Binomial:
...     def __init__(self, n, p):
...         self.n = n
...         self.p = p
...     def pmf(self, x):
...         # note that the pmf doesn't need to be normalized.
...         return self.p**x * (1-self.p)**(self.n-x)
...     def support(self):
...         return (0, self.n)
... 
>>> n, p = 10, 0.2
>>> dist = Binomial(n, p)
>>> rng = DiscreteAliasUrn(dist, random_state=urng)

现在,我们可以使用 rvs 方法,并测量样本的拟合优度:

>>> rvs = rng.rvs(1000)
>>> _, freqs = np.unique(rvs, return_counts=True)
>>> freqs = freqs / np.sum(freqs)
>>> obs_freqs = np.zeros(11)  # some frequencies may be zero.
>>> obs_freqs[:freqs.size] = freqs
>>> pv = [dist.pmf(i) for i in range(0, 11)]
>>> pv = np.asarray(pv) / np.sum(pv)
>>> chisquare(obs_freqs, pv).pvalue
0.9999999999999999

要检查样本是否从正确的分布中提取,我们可以可视化样本的直方图:

>>> import matplotlib.pyplot as plt
>>> rvs = rng.rvs(1000)
>>> fig = plt.figure()
>>> ax = fig.add_subplot(111)
>>> x = np.arange(0, n+1)
>>> fx = dist.pmf(x)
>>> fx = fx / fx.sum()
>>> ax.plot(x, fx, 'bo', label='true distribution')
>>> ax.vlines(x, 0, fx, lw=2)
>>> ax.hist(rvs, bins=np.r_[x, n+1]-0.5, density=True, alpha=0.5,
...         color='r', label='samples')
>>> ax.set_xlabel('x')
>>> ax.set_ylabel('PMF(x)')
>>> ax.set_title('Discrete Alias Urn Samples')
>>> plt.legend()
>>> plt.show()
../../_images/scipy-stats-DiscreteAliasUrn-1_00_00.png

要设置 urn_factor ,请使用:

>>> rng = DiscreteAliasUrn(pv, urn_factor=2, random_state=urng)

这使用两倍于概率向量大小的表从分布生成随机变量。

方法:

rvs \([size] )

分发的样本。

set_random_state \([random_state] )

设置基础均匀随机数生成器。