scipy.cluster.hierarchy.to_mlab_linkage¶

scipy.cluster.hierarchy.to_mlab_linkage(Z)[源代码]¶

将链接矩阵转换为与MATLAB(TM)兼容的矩阵。

转换链接矩阵 Z 由该模块的链接功能生成到与MATLAB(TM)兼容的模块。返回链接矩阵删除了最后一列，并将聚类索引转换为 1..N 正在编制索引。

参数

Zndarray: 生成的链接矩阵 scipy.cluster.hierarchy 。

退货

to_mlab_linkagendarray

与MATLAB(TM)的分级聚类功能兼容的链接矩阵。

返回链接矩阵删除了最后一列，并将聚类索引转换为 1..N 正在编制索引。

参见

linkage: 有关链接矩阵是什么的说明，请参阅。
from_mlab_linkage: 将Matlab格式转换为SciPy格式。

示例

>>> from scipy.cluster.hierarchy import ward, to_mlab_linkage
>>> from scipy.spatial.distance import pdist

>>> X = [[0, 0], [0, 1], [1, 0],
...      [0, 4], [0, 3], [1, 4],
...      [4, 0], [3, 0], [4, 1],
...      [4, 4], [3, 4], [4, 3]]

>>> Z = ward(pdist(X))
>>> Z
array([[ 0.        ,  1.        ,  1.        ,  2.        ],
       [ 3.        ,  4.        ,  1.        ,  2.        ],
       [ 6.        ,  7.        ,  1.        ,  2.        ],
       [ 9.        , 10.        ,  1.        ,  2.        ],
       [ 2.        , 12.        ,  1.29099445,  3.        ],
       [ 5.        , 13.        ,  1.29099445,  3.        ],
       [ 8.        , 14.        ,  1.29099445,  3.        ],
       [11.        , 15.        ,  1.29099445,  3.        ],
       [16.        , 17.        ,  5.77350269,  6.        ],
       [18.        , 19.        ,  5.77350269,  6.        ],
       [20.        , 21.        ,  8.16496581, 12.        ]])

在链接矩阵之后 Z 已经创建，我们可以使用 scipy.cluster.hierarchy.to_mlab_linkage 要将其转换为MATLAB格式，请执行以下操作：

>>> mZ = to_mlab_linkage(Z)
>>> mZ
array([[  1.        ,   2.        ,   1.        ],
       [  4.        ,   5.        ,   1.        ],
       [  7.        ,   8.        ,   1.        ],
       [ 10.        ,  11.        ,   1.        ],
       [  3.        ,  13.        ,   1.29099445],
       [  6.        ,  14.        ,   1.29099445],
       [  9.        ,  15.        ,   1.29099445],
       [ 12.        ,  16.        ,   1.29099445],
       [ 17.        ,  18.        ,   5.77350269],
       [ 19.        ,  20.        ,   5.77350269],
       [ 21.        ,  22.        ,   8.16496581]])

新的连杆矩阵 mZ 对所有簇使用1索引(而不是0索引)。此外，还删除了原始链接矩阵的最后一列。

scipy.cluster.hierarchy.maxRstat

scipy.cluster.hierarchy.dendrogram